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琼脂糖Agarose是琼脂中不带电荷的中性组成成分，化学结构由β-D-吡喃半乳糖（1-4）连接3,6-脱水α-L-吡喃半乳糖基单位构成.把琼脂糖，即几乎不含硫酸根的主要成分为多糖的琼脂，溶于热水，冷却制成的凝胶。制成的小颗粒用于凝胶过滤。适于用sephadex不能分级分离的大分子的凝胶过滤，若使用5%以下浓度的凝胶，也能够分级分离细胞颗粒、病毒等。利用其吸附性小的特点，有时用它代替琼脂、以作为免疫电泳或凝胶内沉降反应的支持物。

DNA、脂蛋白和免疫电泳用；生化研究免疫扩散等的底物。琼脂糖是线性的多聚物，基本结构是1,3连结的β-D-半乳呋糖和1,4连结的3,6-脱水α-L-半乳呋喃糖。琼脂果胶是由许多更小的分子组成的异质混合物。琼脂糖在水中一般加热到90℃以上溶解，温度下降到35～40℃时形成良好的半固体状的凝胶，这是它具有多种用途的主要特征和基础。琼脂糖凝胶性能通常凝胶强度标志。强度越高，凝胶性能越好。